Behandling af akutte tilstande med øjendråber bør ikke kombineres med brug af kontaktlinser. Ved kroniske tilstande kan øjendråbebehandling og brug af kontaktlinser i nogle tilfælde kombineres.  

Hvis kontaktlinser anvendes, bør man vente med at indsætte kontaktlinsen til mindst 15 min. efter applikation af øjendråben. 

Binding af lægemiddelstoffet til kontaktlinsen kan give uforudsigelig virkning, da både øget og nedsat effekt af lægemiddelstoffet kan forekomme, ligesom suspensioner af mikrokrystaller, som fx steroider, kan beskadige cornea.  

En blød kontaktlinse kan medføre forlænget kontakttid for et indgivet lægemiddelstof, men binding af stoffet til kontaktlinsen kan også nedsætte dets virkning. 

Øjendråber konserveret med benzalkoniumchlorid kan misfarve bløde kontaktlinser.