Forebyggelse af dyb venøs trombose og tromboemboliske komplikationer i forbindelse med større ortopædkirurgiske indgreb i underekstremiteterne, som fx hoftefraktur og knæ- eller hoftealloplastik. Forebyggelse af iskæmiske komplikationer hos patienter med ustabil angina pectoris,  non-STEMI og STEMI. Desuden medicinske patienter, som har høj risiko for venøse tromboemboliske komplikationer. 

Virkemåden er analog til heparin, idet et pentasaccharid er den korteste kulhydratsekvens, der kan katalysere antitrombins anti-faktor X_a-aktivitet. Pentasacchariderne adskiller sig fra heparin ved at have længere halveringstid og udelukkende anti-faktor X_a-effekt, ingen trombinhæmmende eller anden antikoagulerende virkning. Pentasaccharider bindes ikke til pladefaktor 4 eller trombocytter. Profylaktiske doser påvirker ikke APTT, INR eller kapillærblødningstiden. Den antikoagulerende effekt kan kvantiteres ved bestemmelse af anti-faktor X_a, hvis fondaparinux anvendes til kalibrering af analysen.